1、氣相色譜儀必須放在有充足光線和干燥的房間，不可在有酸堿氣體、潮濕的實驗室中使用，不可放置于高溫爐、水槽旁。
2、供試品的折光率受溫度影響較大，因此在測定時需恒定溫度至少半小時。
3、上、下棱鏡必須清潔，勿用粗糙的紙或酸性乙醚擦拭棱鏡，氣相色譜儀不能用于強酸性、強堿性、腐蝕性供試品的測定。
4、氣相色譜儀滴加供試品時注意玻璃棒或滴管尖不能觸及棱鏡，以免產(chǎn)生劃痕。加入的量要適中，不得有氣泡進入。
5、測定揮發(fā)性液體時，可將上、下棱鏡關(guān)閉，將測定液沿棱鏡進樣孔滴入，隨加隨讀數(shù)。測定固體樣品或用標準玻片校正氣相色譜儀時，只能將固體樣品或標準玻片置于測定棱鏡上，而不能關(guān)閉上、下棱鏡。
6、氣相色譜儀測定結(jié)束時，必須用能溶解供試品的溶劑（如水、乙醇、乙醚）將上、下棱鏡擦拭干凈并晾干。
